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联赛阶段欧冠冠军和“欧战积分”排名前8的俱乐部为第一档球队（即种子队），其余27支队伍根据“欧战积分”分为二三四档。每支球队将与4个分档中分别随机抽取的2队共8支球队各进行一场比赛，主客场由抽签决定需保证每支球队有4个主场和99足球网4个客场，同协会球队不会相遇，每支球队最多只能与来自同一协会的两支球队相遇。淘汰赛每轮比赛均为主客场两回合，如遇不可抗力会安排在中立场地进行比赛；决赛在中立场地进行。淘汰赛附加赛抽签规则：联赛阶段积分9-16的球队为种子队，积分17-24的球队为非种子队，种子队与非种子队进行主客场两回合比赛，非种子队先主后客，优胜者进入16强。1/8决赛抽签规则：联赛阶段积分1-8的球队为种子队，淘汰赛附加赛优胜的8队为非种子队，种子与非种子队进行主客场两回合比赛，非种子队先主后客，优胜者进入8强。

淘汰赛 从1/8决赛直到决赛均以主99足球网客制两回合进行，若两队在规定时间打成平局，客场进球多的一方将晋级下一轮，否则将会直接以点球决出冠军球队。从2019年赛季开始，决赛改为中立场地举行，采用一场定胜负。巴西的弗拉门戈足球俱乐部在2019赛季决赛中2比1逆转战胜阿根廷豪门河床竞技足球俱乐部，成为决赛改制后的第一届冠军。

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